Nel duodeno, l'acidità del chimo, viene neutralizzata dal bicarbonato di sodio, contenuto nei succhi pancreatici. Inoltre, il chimo viene spruzzato di bile, un liquido che ha il compito di emulsionare i grassi (azione meccanica). Gli enzimi che hanno il compito di completare la digestione, sono contenuti nei succhi pancreatico ed enterico (secreto da ghiandole poste nelle pareti dell'intestino), che hanno il compito di scomporre le diverse categorie di macromolecole. Al termine di tutto il processo digestivo, le proteine sono state trasformate in aminoacidi.
Si definisce assorbimento il meccanismo con cui gli alimenti passano attraverso le pareti dell'intestino tenue ed entrano nell'apparato circolatorio.
Il processo avviene attraverso i villi intestinali, al cui interno,scorrono due tipi di vasi: i capillari sanguigni, che ricevono le vitamine idrosolubili, i monosaccaridi e gli aminoacidi; i vasi linfatici, ricevono i monomeri dei grassi e le vitamine liposolubili.
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